Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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