Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfe3Q64092 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tfe3Q64092 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms