Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Col4a5Q63ZW6 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a5Q63ZW6 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms