Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SspnQ62147 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
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