Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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PcolceQ61398 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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PcolceQ61398 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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PcolceQ61398 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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PcolceQ61398 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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PcolceQ61398 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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PcolceQ61398 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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PcolceQ61398 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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PcolceQ61398 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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PcolceQ61398 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcolceQ61398 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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PcolceQ61398 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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