Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atf3Q60765 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf3Q60765 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms