Protein–RNA interactions for Protein: Q60715

P4ha1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha1Q60715 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P4ha1Q60715 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms