Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc27a1Q60714 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.4 ms