Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SkiQ60698 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SkiQ60698 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SkiQ60698 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SkiQ60698 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SkiQ60698 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SkiQ60698 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SkiQ60698 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SkiQ60698 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SkiQ60698 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SkiQ60698 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SkiQ60698 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SkiQ60698 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SkiQ60698 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SkiQ60698 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SkiQ60698 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SkiQ60698 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SkiQ60698 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SkiQ60698 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SkiQ60698 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SkiQ60698 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SkiQ60698 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SkiQ60698 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SkiQ60698 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SkiQ60698 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SkiQ60698 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SkiQ60698 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SkiQ60698 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SkiQ60698 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SkiQ60698 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SkiQ60698 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SkiQ60698 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SkiQ60698 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SkiQ60698 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SkiQ60698 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SkiQ60698 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SkiQ60698 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SkiQ60698 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SkiQ60698 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SkiQ60698 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SkiQ60698 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SkiQ60698 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SkiQ60698 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SkiQ60698 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SkiQ60698 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SkiQ60698 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SkiQ60698 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SkiQ60698 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SkiQ60698 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SkiQ60698 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SkiQ60698 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SkiQ60698 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SkiQ60698 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SkiQ60698 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SkiQ60698 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SkiQ60698 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SkiQ60698 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SkiQ60698 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SkiQ60698 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SkiQ60698 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SkiQ60698 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SkiQ60698 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SkiQ60698 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SkiQ60698 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SkiQ60698 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SkiQ60698 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SkiQ60698 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SkiQ60698 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SkiQ60698 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SkiQ60698 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SkiQ60698 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms