Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp18Q5SSI6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms