Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms