Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms