Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm44Q3V089 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms