Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc9Q3V038 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ttc9Q3V038 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ttc9Q3V038 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc9Q3V038 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms