Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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H2-Eb2Q3UUV9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb2Q3UUV9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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H2-Eb2Q3UUV9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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H2-Eb2Q3UUV9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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H2-Eb2Q3UUV9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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H2-Eb2Q3UUV9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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H2-Eb2Q3UUV9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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H2-Eb2Q3UUV9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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H2-Eb2Q3UUV9 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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H2-Eb2Q3UUV9 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb2Q3UUV9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb2Q3UUV9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb2Q3UUV9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb2Q3UUV9 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Eb2Q3UUV9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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