Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
E130208F15RikQ3UPV3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms