Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc4Q3UP44 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc4Q3UP44 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc4Q3UP44 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc4Q3UP44 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc4Q3UP44 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc4Q3UP44 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc4Q3UP44 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc4Q3UP44 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc4Q3UP44 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc4Q3UP44 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc4Q3UP44 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc4Q3UP44 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc4Q3UP44 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc4Q3UP44 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nhlrc4Q3UP44 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nhlrc4Q3UP44 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nhlrc4Q3UP44 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nhlrc4Q3UP44 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nhlrc4Q3UP44 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nhlrc4Q3UP44 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nhlrc4Q3UP44 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nhlrc4Q3UP44 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nhlrc4Q3UP44 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nhlrc4Q3UP44 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc4Q3UP44 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms