Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp19Q3UJD6 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms