Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Rnf224Q3UIW8 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Rnf224Q3UIW8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Rnf224Q3UIW8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Rnf224Q3UIW8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Rnf224Q3UIW8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf224Q3UIW8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms