Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Nkx6-3Q3UHX8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Nkx6-3Q3UHX8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms