Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trafd1Q3UDK1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms