Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf180Q3U827 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms