Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gse1Q3U3C9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms