Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LcorlQ3U285 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LcorlQ3U285 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms