Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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