Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43aQ3TL54 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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