Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms