Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Hdgfl1Q2VPR5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hdgfl1Q2VPR5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Hdgfl1Q2VPR5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Hdgfl1Q2VPR5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hdgfl1Q2VPR5 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hdgfl1Q2VPR5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl1Q2VPR5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdgfl1Q2VPR5 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms