Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms