Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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