Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col19a1Q0VF58 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col19a1Q0VF58 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col19a1Q0VF58 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col19a1Q0VF58 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col19a1Q0VF58 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col19a1Q0VF58 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col19a1Q0VF58 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col19a1Q0VF58 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col19a1Q0VF58 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col19a1Q0VF58 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col19a1Q0VF58 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col19a1Q0VF58 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col19a1Q0VF58 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col19a1Q0VF58 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col19a1Q0VF58 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col19a1Q0VF58 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col19a1Q0VF58 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Col19a1Q0VF58 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col19a1Q0VF58 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Col19a1Q0VF58 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col19a1Q0VF58 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col19a1Q0VF58 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col19a1Q0VF58 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col19a1Q0VF58 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col19a1Q0VF58 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col19a1Q0VF58 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Col19a1Q0VF58 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Col19a1Q0VF58 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Col19a1Q0VF58 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Col19a1Q0VF58 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Col19a1Q0VF58 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Col19a1Q0VF58 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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