Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms