Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms