Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms