Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Cnn1Q08091 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Cnn1Q08091 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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Cnn1Q08091 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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Cnn1Q08091 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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Cnn1Q08091 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms