Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou6f1Q07916 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms