Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
MestQ07646 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MestQ07646 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
MestQ07646 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MestQ07646 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MestQ07646 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MestQ07646 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MestQ07646 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MestQ07646 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms