Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col9a2Q07643 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col9a2Q07643 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms