Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NrepQ07475 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms