Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms