Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms