Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a1Q04857 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a1Q04857 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a1Q04857 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a1Q04857 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a1Q04857 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a1Q04857 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a1Q04857 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a1Q04857 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a1Q04857 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a1Q04857 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a1Q04857 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a1Q04857 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a1Q04857 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a1Q04857 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a1Q04857 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a1Q04857 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a1Q04857 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a1Q04857 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a1Q04857 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a1Q04857 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a1Q04857 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a1Q04857 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a1Q04857 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col6a1Q04857 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms