Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms