Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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NfiaQ02780 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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NfiaQ02780 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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NfiaQ02780 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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NfiaQ02780 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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NfiaQ02780 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms