Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms