Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pax5Q02650 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms