Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ascl1Q02067 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms