Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms