Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms