Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms